Vanhoudt nahm 1989 am Juniorenturnier von Wimbledon teil. Im Einzel scheiterte er in der ersten Runde, im Doppel erreichte er an der Seite seines Landsmanns Filip Dewulf die zweite Runde. Im Jahr darauf nahm er erneut in der Juniorenkonkurrenz des Turniers teil, schied jedoch sowohl im Einzel als auch im Doppel in der ersten Runde aus. 1991 wurde er Tennisprofi, wobei er seine Karriereerfolge allesamt im Herrendoppel hatte. Zwischen 1992 und 2005 errang er an der Seite wechselnder Partner 27 Doppeltitel auf der ATP Challenger Tour. Seinen größten Erfolg auf der ATP World Tour feierte er 1993 beim Turnier in Umag, seinem einzigen ATP-Karrieretitel. Die höchste Notierung in der Tennis-Weltrangliste erreichte er 1996 mit Position 203 im Einzel sowie 2001 mit Position 36 im Doppel.
Im Einzel konnte er sich nie für eines der Grand-Slam-Turniere qualifizieren. In der Doppelkonkurrenz erreichte er jeweils das Viertelfinale der Australian Open und von Wimbledon. In der Mixed-Konkurrenz stand er zwei Mal im Achtelfinale von Wimbledon.
Vanhoudt spielte zwischen 1991 und 2002 neun Doppelpartien für die belgische Davis-Cup-Mannschaft. Seine Bilanz war 4 Siege bei 5 Niederlagen.
Belgien
Umag
Jordi Arrese