Die Liste von Flüssen in Japan enthält eine Auswahl von Fließgewässern in Japan, sortiert nach Region.

Japan besitzt trotz seiner geringen Breite vergleichsweise hohe Gebirge, die sich über den Großteil des Landes erstrecken. Diese Gebirge sind aufgrund von Störungslinien und Deformationen durch viele senkrechte Felswände und enge Gesteinsfalten geprägt. Daraus ergibt sich für die japanischen Flüsse die Besonderheit, dass diese im Allgemeinen dazu neigen senkrecht zu den Gebirgszügen abzufließen und dabei ein kurzes und äußerst steiles Längsprofil aufweisen. Daher besitzt auch der Shinano, der mit 367 km der längste Fluss Japans ist, einen größeren Gefällegradienten als die meisten außerjapanischen Flüsse.^[1]

Hinzu kommt, dass die Flüsse in Kombination mit der Tiefenerosion auch ein hohes Hanggefälle aufweisen – in den Japanischen Alpen oft bis 35°.^[1][2] So wird erzählt, dass der niederländische Flussbauingenieur Johannis de Rijke, der als ausländischer Ratgeber in Japan beschäftigt war, beim Anblick des Jōganji 1891 überrascht gesagt haben soll: „Das ist kein Fluss, sondern ein Wasserfall!“.^[1]

Rechtlich werden die Flusssysteme vom „Flussgesetz“ (jap. 河川法, kasen-hō) in zwei Ordnungen eingeteilt. „Flusssysteme 1. Ordnung“ (一級水系, ikkyū suikei) sind jene Flusssysteme, die aufgrund ihrer Ausdehnung dem Ministerium für Land, Infrastruktur, Transport und Tourismus (MLIT) zugeordnet sind. Danach kommen die „Flusssysteme 2. Ordnung“ (二級水系, nikyū suikei), die von den jeweiligen Präfekturen verwaltet werden. Flüsse, die Teil dieser Flusssysteme sind, werden entsprechend als „Fluss 1. Ordnung“ (一級河川, ikkyū kasen) oder „Fluss 2. Ordnung“ (二級河川, nikyū kasen) bezeichnet. Daneben gibt es noch kleinere Flusssysteme, die sich nur über einzelne Gemeinden erstrecken und als „Einzelflusssysteme“ (単独水系, tandoku suikei) bezeichnet werden.^[3]

1998 wurden 109 „Flusssysteme 1. Ordnung“ mit 13.935 Flüssen, sowie 2.713 „Flusssysteme 2. Ordnung“ mit 7.029 Flüssen gezählt.^[3]

In Japan existieren folgende „Flusssysteme 1. Ordnung“ in den einzelnen Regionen (als Länge ist jeweils die des Hauptstroms angegeben):^[4]

• Gesamtkarte und Dokumente zu den Flusssystemen 1. Ordnung. MLIT (japanisch).
• Überblicksinformationen zu den Flusssystemen 1. Ordnung. MLIT (japanisch).
• Flussinformationen. japanriver.or.jp (japanisch)

1. ↑ ^{a b c} Takashi Oguchi, Kyoji Saito, Hiroshi Kadomura, Michael Grossman: Fluvial Geomorphology and Paleohydrology in Japan. In: Geomorphology. Vol. 39, 2001, 2.1 Steep watersheds, S. 3–19, doi:10.1016/S0169-555X(01)00048-4 (csis.u-tokyo.ac.jp [PDF]). 
2. ↑ Keiichi Katsube, Takashi Oguchi: Altitudinal Changes in Slope Angle and Profile Curvature in the Japan Alps: A Hypothesis Regarding a Characteristic Slope Angle. In: Geographical Review of Japan (Series B). Vol. 72, Nr. 1, 1999, S. 63–72 (csis.u-tokyo.ac.jp [PDF]). 
3. ↑ ^{a b} 水辺づくり用語集. 国土交通省 東北地方整備局, abgerufen am 31. August 2011 (japanisch). 
4. ↑ 日本の川. 国土交通省 河川局, abgerufen am 31. August 2011 (japanisch).