Sie heiratete am 12. Juni 1792 in Homburg Erbprinz Friedrich von Anhalt-Dessau (1769–1814). Um die Erziehung und Ausbildung ihrer Kinder kümmerte sie sich persönlich und gründlich.
Sie kaufte am 6. Februar 1797 das Erb- und Allodialgut Priorau vom Oberforstmeister Heinrich Otto von Görschen.
Christiane Amalie bewohnte mit ihrer Familie das Erbprinzliche Palais an der Dessauer Kavalierstraße. Nach dem Tod ihres Mannes erhielt sie das Schloss Georgium als Sommersitz zugewiesen.
Der Schriftsteller Friedrich Hölderlin widmete ihr sein um 1800 geschriebenes Gedicht Aus stillem Hauße senden – An eine Fürstin von Dessau.